加拿大生活：DNA條形碼融合技術
2016/04/28 10:16:35
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作者:世貿通移民
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爲醫療制度移民海外的華人，逐年增多。比如移民加拿大，你會發現這裏的醫療技術和儀器非常先進。據最新一期《分子系統生物學》報道，加拿大研究人員開發出一種新技術，可將DNA(脫氧核糖核酸)條形碼拼接在單個細胞內，以同時搜索數以百萬計蛋白質對之間的相互作用。
近年來，DNA條形碼技術使科學家開展高並行試驗(許多不同類型的細胞在同一試管內進行試驗)成爲可能，而新一代DNA測序技術的發展，進一步提高了對條形碼計數和讀取結果的效率。
然而，可在同一試管內進行的試驗次數，卻受限于編碼的細胞類型數量。一直以來，DNA條形碼都是一維的，也就是一個條形碼只能做一次試驗。允許條形碼在細胞內融合在一起，意味著科學家們現在可以打破這一障礙。新技術可顯著提高在單一試管內進行的實驗次數，在同等成本條件下能將效率提高10倍。
在廣泛使用的酵母雙雜交(Y2H)方法中，攜帶一個“誘餌”蛋白的酵母細胞與攜帶一個“獵物”蛋白的酵母細胞配對。對Y2H系統進行操縱後，只有“誘餌”與“獵物”蛋白黏在一起的細胞才能存活，從而使科學家可以觀察到哪些蛋白間互相關聯。在被命名爲“條形碼融合遺傳學—酵母雙雜交(BFG-Y2H)”的新技術中，攜帶著數千“誘餌”和“獵物”蛋白的細胞在同一培養皿中配對。
BFG-Y2H方法的新穎之處在于，通過對細胞編程，將來自“誘餌”和“獵物”細胞的DNA條形碼連接在一起，形成一個“融合條形碼”，然後利用新一代DNA測序方法對融合條形碼進行檢測。
研究人員稱，這項研究的最終目標，是建立蛋白相互作用網絡的三維視圖，而不是靜態圖。通過有效建立含有更豐富信息的蛋白相互作用圖譜，BFG-Y2H方法可拓展研究人員對細胞工作機理的理解，並展現只在某種特定環境條件下才能發生的蛋白相互作用，從而加速對基因功能和人類疾病的理解。
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